On parle d'épilepsie cryptogénique lorsque l'origine de l'épilepsie est inconnue mais qu'une cause lésionnelle non visible est suspectée sans pouvoir être prouvée. Les épilepsies cryptogéniques représentent 30% des cas environ mais les nouvelles techniques d'exploration tendent à faire diminuer ce chiffre. L'épilepsie myoclonique sévère du nourrisson est un exemple d'épilepsie cryptogénique.

Pour préciser le type d'épilepsie que présente un patient, le médecin se repose sur :

• le ou les types de crises que présente le patient;
• l'âge de survenue des premiers signes de la maladie;
• le tracé de l'électroencéphalogramme ( EEG) pendant une crise ou entre les crises;
• éventuellement, la cause de l'épilepsie si celle-ci est accessible par l'observation du patient, les examens et explorations complémentaires pratiqués chez le patient voire parfois chez ses parents.